FBMLの利用が非推奨になるので
Facebookアプリもiframeを利用するのがデフォルトになるようですが、そのおかげでこれまで、FBMLでは出来なかったようなことも簡単にできます。

たとえば、GoogleMapの表示とかです。サンプル(SSLが必須になったので削除しました)

Facebookアプリケーションの登録の手間を差し引いても、いままでFBMLで苦労してきたことに比べれば、さっさとiframeでつくったほうが楽ちんです。

ただ、iframeも直接サイトを表示しているわけではなくFacebookのプロキシを介しているようなので、なにかしらの制限があるのかもしれないです。